Az Avisivirus nemzetséget 2013-ban hozták létre. Jelenleg egy fajból (Avisivirus A) áll, amelynek tagjait mindeddig csak madarakból (pulyka és csirke) azonosítottak. A nemzetség prototípus vírusa az Avisivirus A1 (AsV-A1, korábbi elnevezése: pulyka avisivirus 1), melyet először kutatócsoportunk azonosított 2013-ban magyarországi háziasított pulyka (Meleagris gallopavo f. domestica) mintákból (Boros és mtsai., 2013). Az AsV-A1-HUN RNS genomja 7532 nukleotid (nt) hosszúságú, amely egy 6720 nt (2239 aminosav) hosszú nyílt leolvasási keretet (ORF) tartalmaz. A vírusgenom a picornavírusokra jellemző felépítéssel rendelkezik: 5’ UTR-P1(VP0-3-1)-P2(2A-B-C)-P3(3A-B-CD)-3’ UTR (1. A. kép). AsV-1.kép.jpg

A P1, P2 és P3 régiók 33, 32 és 36%-os hasonlóságot mutattak a legközelebbi ismert rokon, Avihepatovirus nemzetségbe tartozó kacsa hepatitisz A vírusokkal (Duck hepatitis A virus - DHAV). A vírusgenom egyik legérdekesebb része a 2A genom-régió, amely a DHAV-hoz hasonlóan három, egymástól különböző peptidet (2A1-2A2-2A3) kódol (1. kép). A 76 aminosav (aa) hosszú 2A1 egy DxExNPGP motívumra (x= bármely aminosav) végződő, Aphthovírus 2A-szerű peptid. Részletesebb leírást az NPGP-tartalmú 2A-ról lásd a 2014.03.28-ai bejegyzésemet. The 140 aa hosszú 2A2 a DHAV 2A2 peptidhez hasonlóan tartalmaz egy GxxGxGKS konzervatív motívumot, amely egyben P-hurok-tartalmú nukleozid trifoszfát hidroláz enzimek katalitikus motívuma. A 123 aa hosszúságú 2A3 a DHAV 2A3-jához hasonlóan egy Hbox/NC-tartalmú 2A fehérje (1. kép). A Hbox/NC-tartalmú 2A-ról részletesebben lásd a 2014.03.28-ai bejegyzésemet. A hasonló 2A-szerkezet az avisivírusok és a DHAV-ok rokonságára utalnak, ami a 3D fehérjeszekvenciákból készült filogenetikai fán is jól látható (2. kép).

AsV-2.kép.jpg

A VP1/2A régió vizsgálata egy további DxExNPGP motívum jelenlétét mutatta ki, ami a 2A1 peptid előtt helyezkedik el, és valószínűsíthető, hogy a motívum a VP1/2A hasítási helyként funkcionál. A két DxExNPGP motívum jelenléte valószínűleg egy ”génduplikáció” eredménye. Erre utal a két motívumot tartalmazó genom-szakaszok jelentős szekvencia-hasonlósága (1. B. kép). A víruscsoport első képviselőjének leírása után az avisivírus jelenlétét kimutatták az Egyesült Államokban is (AsV-A1-USA), pulykamintákból (Ng és mtsai., 2013). Az AsV-A1-USA filogenetikailag is nagyon közel állt a magyar avisivírus törzshöz (2. kép), valamint RNS genomja is hasonló felépítést mutatott az AsV-A1-HUN genomjához (3. kép). A legjelentősebb különbség a két vírustörzs között az volt, hogy az AsV-A1-USA genomja csak egy DxExNPGP motívumot tartalmazott (3. kép). A két avisivírus szekvencia illesztése alapján valószínűsíthető hogy az amerikai avisivírus törzsből hiányzik a 2A1 genom régió. Az AsV-A1-USA genomjának DxExNPGP motívuma valószínűleg a VP1 C-terminális végén helyezkedik el (3. kép). A 2A genom régió különbözősége a magyar és az amerikai avisivírus törzsekben a 2A genom régiónak, a többi genom régióhoz mérten gyorsabb evolúciós változékonyságára utalnak. Az avisivírusok jelenlétét nemrég kimutatták házi csirkékből is (Lau és mtsai., 2014), ahol magyar és amerikai avisivírusokhoz hasonlóan, a két azonosított csirke avisivírus közül az egyik (chicken picornavirus 2) két darab, míg a másik (chicken picornavirus 3) csak egy DxExNPGP motívumot tartalmazott.

AsV-3.kép.jpg

 

Referenciák

Boros, Á., Nemes, C., Pankovics, P., Kapusinszky, B., Delwart, E., Reuter, G., 2013.Genetic characterization of a novel picornavirus in turkeys (Meleagris gallopavo) distinct from turkey galliviruses and megriviruses and distantly related to the members of the genus Avihepatovirus. J. Gen. Virol. 94, 1496–1509.

Ng. T.F., Cheung, A.K., Wong, W., Lager, K.M., Kondov, N.O., Cha, Y., Murphy, D.A., Pogranichniy, R.M., Delwart, E., 2013. Divergent picornavirus from a Turkey with gastrointestinal disease. Genome Announc. 2, e00134-13.

Lau, S.K., Woo, P.C., Yip, C.C., Li, K.S., Fan, R.Y., Bai, R., Huang, Y., Chan, K.H. and Yuen, K.Y. (2014). Chickens host diverse picornaviruses originated from potential interspecies transmission with recombination. J Gen Virol. 2014 Jun 6. pii: vir.0.066597-0. doi: 10.1099/vir.0.066597-0. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 24906980.

Szerző: borosakos